MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_80

Total Repeats: 931

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009786	CAA	2	6	320	325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149378
2	NC_009786	CAA	2	6	550	555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149378
3	NC_009786	ATG	2	6	1348	1353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149386
4	NC_009786	GCAG	2	8	1386	1393	25 %	0 %	50 %	25 %	157149386
5	NC_009786	GGC	2	6	1452	1457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149386
6	NC_009786	G	6	6	1508	1513	0 %	0 %	100 %	0 %	157149386
7	NC_009786	CGG	2	6	1632	1637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149386
8	NC_009786	GCTG	2	8	1664	1671	0 %	25 %	50 %	25 %	157149386
9	NC_009786	ATT	2	6	1675	1680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149386
10	NC_009786	ATC	2	6	1714	1719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149386
11	NC_009786	C	6	6	1754	1759	0 %	0 %	0 %	100 %	157149386
12	NC_009786	TTA	2	6	1800	1805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149386
13	NC_009786	GGT	2	6	1863	1868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149386
14	NC_009786	CTG	2	6	1885	1890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149386
15	NC_009786	CGG	2	6	1913	1918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149386
16	NC_009786	GATT	2	8	1971	1978	25 %	50 %	25 %	0 %	157149386
17	NC_009786	TGC	2	6	2003	2008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149386
18	NC_009786	CG	3	6	2128	2133	0 %	0 %	50 %	50 %	157149386
19	NC_009786	GCG	2	6	2140	2145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149386
20	NC_009786	GGT	2	6	2166	2171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149386
21	NC_009786	CAGCA	2	10	2191	2200	40 %	0 %	20 %	40 %	157149386
22	NC_009786	GC	3	6	2226	2231	0 %	0 %	50 %	50 %	157149386
23	NC_009786	CTG	2	6	2251	2256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149386
24	NC_009786	GACG	2	8	2277	2284	25 %	0 %	50 %	25 %	157149386
25	NC_009786	TGA	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149386
26	NC_009786	CGG	2	6	2324	2329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149386
27	NC_009786	TGAG	2	8	2360	2367	25 %	25 %	50 %	0 %	157149386
28	NC_009786	TAC	2	6	2386	2391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149386
29	NC_009786	CCGT	2	8	2392	2399	0 %	25 %	25 %	50 %	157149386
30	NC_009786	CCA	2	6	2477	2482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149386
31	NC_009786	TGG	2	6	2510	2515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149386
32	NC_009786	CCG	2	6	2593	2598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149386
33	NC_009786	GGC	2	6	2652	2657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149386
34	NC_009786	CTGT	2	8	2687	2694	0 %	50 %	25 %	25 %	157149386
35	NC_009786	CAG	2	6	2887	2892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149386
36	NC_009786	CCCGTT	2	12	2922	2933	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	157149386
37	NC_009786	TGG	2	6	2951	2956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149386
38	NC_009786	TGA	2	6	3018	3023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149386
39	NC_009786	GAG	2	6	3076	3081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149386
40	NC_009786	CGG	2	6	3089	3094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149386
41	NC_009786	ACGCC	2	10	3112	3121	20 %	0 %	20 %	60 %	157149386
42	NC_009786	ACG	2	6	3155	3160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149386
43	NC_009786	GC	3	6	3226	3231	0 %	0 %	50 %	50 %	157149386
44	NC_009786	AGG	3	9	3242	3250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149386
45	NC_009786	GGA	2	6	3275	3280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149388
46	NC_009786	GTT	2	6	3329	3334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149388
47	NC_009786	CTG	2	6	3336	3341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149388
48	NC_009786	GTG	2	6	3350	3355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149388
49	NC_009786	GCT	2	6	3356	3361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149388
50	NC_009786	CGGC	2	8	3436	3443	0 %	0 %	50 %	50 %	157149388
51	NC_009786	TTTA	2	8	3477	3484	25 %	75 %	0 %	0 %	157149388
52	NC_009786	AC	3	6	3526	3531	50 %	0 %	0 %	50 %	157149388
53	NC_009786	TGA	2	6	3538	3543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149388
54	NC_009786	ATG	2	6	3555	3560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149388
55	NC_009786	GCAT	2	8	3595	3602	25 %	25 %	25 %	25 %	157149388
56	NC_009786	CTG	2	6	3609	3614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149388
57	NC_009786	AGG	2	6	3722	3727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149388
58	NC_009786	ATA	2	6	4349	4354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149373
59	NC_009786	GCCA	2	8	4421	4428	25 %	0 %	25 %	50 %	157149373
60	NC_009786	CAC	2	6	4429	4434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149373
61	NC_009786	T	6	6	4435	4440	0 %	100 %	0 %	0 %	157149373
62	NC_009786	GTC	2	6	4447	4452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149373
63	NC_009786	TCG	2	6	4518	4523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149373
64	NC_009786	GAA	2	6	4558	4563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149373
65	NC_009786	CTG	2	6	4651	4656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149373
66	NC_009786	CTT	2	6	4662	4667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149373
67	NC_009786	CA	3	6	4831	4836	50 %	0 %	0 %	50 %	157149373
68	NC_009786	TCAGT	2	10	4869	4878	20 %	40 %	20 %	20 %	157149373
69	NC_009786	GCCA	2	8	4916	4923	25 %	0 %	25 %	50 %	157149373
70	NC_009786	CAG	2	6	4930	4935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149373
71	NC_009786	TTCT	2	8	4936	4943	0 %	75 %	0 %	25 %	157149373
72	NC_009786	TGA	2	6	4986	4991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149373
73	NC_009786	GGT	2	6	5173	5178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149373
74	NC_009786	ATCC	2	8	5212	5219	25 %	25 %	0 %	50 %	157149373
75	NC_009786	GT	3	6	5389	5394	0 %	50 %	50 %	0 %	157149373
76	NC_009786	CAG	2	6	5434	5439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149373
77	NC_009786	ACTG	2	8	5448	5455	25 %	25 %	25 %	25 %	157149373
78	NC_009786	TC	3	6	5661	5666	0 %	50 %	0 %	50 %	157149387
79	NC_009786	T	6	6	5697	5702	0 %	100 %	0 %	0 %	157149387
80	NC_009786	GCT	2	6	5703	5708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149387
81	NC_009786	CAA	2	6	5713	5718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149387
82	NC_009786	CTTT	2	8	5739	5746	0 %	75 %	0 %	25 %	157149387
83	NC_009786	ATC	2	6	5774	5779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149387
84	NC_009786	GCT	2	6	5787	5792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149387
85	NC_009786	CAA	2	6	5795	5800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149387
86	NC_009786	AAG	2	6	5822	5827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149387
87	NC_009786	C	6	6	5879	5884	0 %	0 %	0 %	100 %	157149387
88	NC_009786	TGT	2	6	5892	5897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149387
89	NC_009786	CCAG	2	8	5911	5918	25 %	0 %	25 %	50 %	157149387
90	NC_009786	TAG	2	6	6014	6019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149387
91	NC_009786	TGC	2	6	6023	6028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149387
92	NC_009786	TCT	2	6	6081	6086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149387
93	NC_009786	AAG	2	6	6104	6109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149387
94	NC_009786	C	7	7	6160	6166	0 %	0 %	0 %	100 %	157149387
95	NC_009786	TC	3	6	6248	6253	0 %	50 %	0 %	50 %	157149387
96	NC_009786	TGA	2	6	6267	6272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149387
97	NC_009786	TGC	2	6	6297	6302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149387
98	NC_009786	GCA	2	6	6372	6377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149387
99	NC_009786	GCG	2	6	6424	6429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149387
100	NC_009786	CT	3	6	6464	6469	0 %	50 %	0 %	50 %	157149387
101	NC_009786	CAAT	2	8	6529	6536	50 %	25 %	0 %	25 %	157149387
102	NC_009786	GCA	2	6	6588	6593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149387
103	NC_009786	AAC	2	6	6644	6649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149387
104	NC_009786	TCA	2	6	6781	6786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149358
105	NC_009786	CCCGT	2	10	6846	6855	0 %	20 %	20 %	60 %	157149358
106	NC_009786	CCG	2	6	6858	6863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149358
107	NC_009786	GCCGC	2	10	6896	6905	0 %	0 %	40 %	60 %	157149358
108	NC_009786	TGA	2	6	7136	7141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149363
109	NC_009786	CAA	2	6	7147	7152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149363
110	NC_009786	ACG	2	6	7177	7182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149363
111	NC_009786	AAT	2	6	7184	7189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149363
112	NC_009786	AC	3	6	7264	7269	50 %	0 %	0 %	50 %	157149363
113	NC_009786	CAC	2	6	7368	7373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149363
114	NC_009786	AACC	2	8	7455	7462	50 %	0 %	0 %	50 %	157149363
115	NC_009786	A	7	7	7503	7509	100 %	0 %	0 %	0 %	157149363
116	NC_009786	TGG	2	6	7520	7525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149363
117	NC_009786	ATTA	2	8	7619	7626	50 %	50 %	0 %	0 %	157149363
118	NC_009786	CAC	2	6	7640	7645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149363
119	NC_009786	TC	3	6	7717	7722	0 %	50 %	0 %	50 %	157149363
120	NC_009786	ATA	2	6	7813	7818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149363
121	NC_009786	ATG	2	6	7840	7845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149363
122	NC_009786	AATG	2	8	7874	7881	50 %	25 %	25 %	0 %	157149363
123	NC_009786	GGT	2	6	7959	7964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149363
124	NC_009786	A	7	7	7991	7997	100 %	0 %	0 %	0 %	157149363
125	NC_009786	CA	4	8	7998	8005	50 %	0 %	0 %	50 %	157149363
126	NC_009786	TGA	2	6	8012	8017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149363
127	NC_009786	T	6	6	8021	8026	0 %	100 %	0 %	0 %	157149363
128	NC_009786	GTAT	2	8	8062	8069	25 %	50 %	25 %	0 %	157149363
129	NC_009786	TAAT	2	8	8078	8085	50 %	50 %	0 %	0 %	157149363
130	NC_009786	ATT	2	6	8513	8518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149383
131	NC_009786	ATAAA	2	10	8521	8530	80 %	20 %	0 %	0 %	157149383
132	NC_009786	TTA	2	6	8541	8546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149383
133	NC_009786	ATT	2	6	8576	8581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149383
134	NC_009786	TTA	2	6	8607	8612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149383
135	NC_009786	AAT	2	6	8705	8710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149383
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265	NC_009786	AGC	2	6	19103	19108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149334
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267	NC_009786	T	6	6	19440	19445	0 %	100 %	0 %	0 %	157149334
268	NC_009786	AG	3	6	19479	19484	50 %	0 %	50 %	0 %	157149334
269	NC_009786	GGT	2	6	19621	19626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149334
270	NC_009786	T	6	6	19690	19695	0 %	100 %	0 %	0 %	157149334
271	NC_009786	TTA	2	6	19839	19844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149334
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289	NC_009786	CAGGTG	2	12	21285	21296	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	157149342
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372	NC_009786	GCG	2	6	26221	26226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149337
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375	NC_009786	ATT	2	6	26672	26677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157149366
376	NC_009786	G	6	6	26753	26758	0 %	0 %	100 %	0 %	157149366
377	NC_009786	CAGC	2	8	26806	26813	25 %	0 %	25 %	50 %	157149366
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380	NC_009786	GA	3	6	26864	26869	50 %	0 %	50 %	0 %	157149366
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